I ghiozzi pigmei nani sono pesci carnivori la cui dieta consiste principalmente in minuscoli animali acquatici. Le loro principali fonti di cibo includono copepodi, anfipodi e altri piccoli crostacei.
Si nutrono anche di larve di insetti, vermi e pesciolini molto piccoli. Occasionalmente possono consumare alghe o altra materia vegetale, ma le prede animali costituiscono la maggior parte della loro dieta.