I funghi sono un regno di organismi che comprende lieviti, stampi e funghi carnosi. Sono eterotrofici, il che significa che ottengono i loro composti organici da altri organismi. I funghi secernono enzimi che abbattono la materia organica complessa in sostanze più semplici che possono assorbire. Nel caso degli animali morti, i funghi svolgono un ruolo essenziale nel processo di decomposizione abbattendo i tessuti e riciclando i nutrienti nel terreno.
I batteri sono microrganismi a cellule singole che sono procariotiche, il che significa che mancano di un nucleo e organelli legati alla membrana. I batteri sono anche eterotrofici e ottengono i loro composti organici da altri organismi. Alcuni batteri sono decompositori, il che significa che abbattono la materia organica morta, compresi gli animali morti. Questi batteri secernono enzimi che abbattono la materia organica complessa in sostanze più semplici che possono assorbire.
In generale, i funghi sono più adatti per abbattere materiali organici complessi, come la lignina e la cellulosa, che sono i principali componenti delle pareti cellulari vegetali. I batteri, d'altra parte, sono più efficienti a abbattere composti organici più semplici, come proteine e zuccheri.
Pertanto, mentre sia i funghi che i batteri si nutrono di animali morti, svolgono ruoli diversi nel processo di decomposizione e hanno capacità diverse basate sui loro enzimi specifici e percorsi metabolici.