Tuttavia, quando più europei iniziarono a visitare Mauritius e le isole circostanti, la popolazione Dodo iniziò a diminuire. A metà del XVII secolo, il Dodo era estinto.
L'estinzione del dodo era in gran parte dovuta all'attività umana. I coloni olandesi che arrivarono a Mauritius nel XVI secolo introdussero maiali, cani e gatti sull'isola. Questi animali predavano le uova del dodo e i giovani e hanno anche gareggiato con il dodo per il cibo. Inoltre, i marinai olandesi cacciavano spesso il dodo per il cibo e per le sue piume.
Quando gli scienziati iniziarono a studiare il dodo, era già estinto. Di conseguenza, dovevano fare affidamento sui resoconti dei primi esploratori europei e sui pochi esemplari sopravvissuti di piume e ossa Dodo. Questi esemplari non erano molto istruttivi e gli scienziati furono lasciati con una comprensione molto limitata del Dodo.
Alla fine del XX secolo, un team di scienziati guidati dal Dr. Julian Hume iniziò un nuovo studio sul Dodo. Hanno usato una varietà di tecniche, tra cui la modellazione informatica e l'analisi del DNA, per ricostruire l'aspetto e il comportamento del Dodo. La loro ricerca ha rivelato che il Dodo era un uccello molto più complesso e interessante di quanto si pensasse in precedenza.
Il Dodo è ora considerato un'icona di estinzione. È un promemoria della fragilità degli ecosistemi del nostro pianeta e dell'importanza di proteggere le specie in via di estinzione.