Eohippus è legato al cavallo moderno attraverso un processo di evoluzione nel corso di milioni di anni. Nel tempo, Eohippus e i suoi discendenti sono cambiati gradualmente e adattati in ambienti diversi. Il numero di piedi su ciascun piede diminuiva da quattro a uno, il collo divenne più lungo e il cranio divenne più allungato. Questi cambiamenti hanno permesso al cavallo di diventare più veloce e meglio adattato a correre su pianure aperte.
L'evoluzione del cavallo di Eohippus è un classico esempio di macroevoluzione, che si riferisce a cambiamenti evolutivi su larga scala che si verificano per lunghi periodi di tempo. Dimostra come le specie possono cambiare radicalmente attraverso la selezione naturale, adattandosi a nuovi ambienti e sopravvivere di fronte alle mutevoli condizioni.