1. Africa sub-sahariana (39 paesi nell'Africa orientale, centrale, meridionale e occidentale):
- Angola
- Benin
- Botswana
- Burkina Faso
- Burundi
- Camerun
- Repubblica centrale dell'Africa
- Chad
- Repubblica democratica del Congo
- Repubblica del Congo
- Côte d'Ivoire
- Etiopia
- Gabon
- Gambia
- Ghana
- Guinea
- Guinea-Bissau
- Kenya
- Liberia
- Madagascar
- Malawi
- Mali
- Mauritania
- Mozambico
- Namibia
- Niger
- Nigeria
- Ruandada
- Senegal
- Sierra Leone
- Somalia
- Sudafrica
- Sud Sudan
- Sudan
- Tanzania
- Togo
- Uganda
- Zambia
- Zimbabwe
2. Africa settentrionale (2 paesi):
- Egitto
- Sudan (parte dell'Africa settentrionale)
È importante notare che mentre i coccodrilli del Nilo occupano una vasta regione in Africa, le loro distribuzioni all'interno dei paesi specificati possono variare e non possono necessariamente coprire l'intera area. Alcune aree possono avere popolazioni più abbondanti e habitat adatti di altre. Inoltre, la popolazione locale e gli sforzi di conservazione possono influenzare la presenza e la distribuzione dei coccodrilli del Nilo.