Pesticidi :I pesticidi usati per controllare i roditori e altri parassiti possono anche avvelenare i cani della prateria.
Malattie :I cani della prateria sono suscettibili a varie malattie, tra cui peste silvatica, tularemia e cimurro canino. Queste malattie possono diffondersi tra le colonie di cani della prateria e causare un calo della popolazione.
caccia :In alcune aree, i cani della prateria vengono cacciati per lo sport o per proteggere il bestiame.
Predazione :Prairie Dogs sono predati da vari predatori, tra cui coyote, lupi, volpi e uccelli di preda.
A causa di questi fattori, diverse specie di cani della prateria sono elencate come minacciate o in via di estinzione ai sensi della legge sulla specie in via di estinzione. Sono in corso sforzi di conservazione per proteggere i loro habitat e gestire le minacce alle loro popolazioni.